Gegenmaßnahmen
Als Gegenmaßnahmen kann man die Wirtspflanzen, die Birne ist der Zwischenwirt und die betroffenen Wacholderarten der Wirt, entfernen, was natürlich nur schwer machbar ist, da die Sporen durch Wind übertragen werden und nicht jeder Gartenfreund die nötige Einsicht hat.
Möglich ist auch die Verdickungen am Wacholder im Winter auszuschneiden und zu vernichten. Das Entfernen der Sporenbeutel im Frühjahr halte ich für einen zu späten Zeitpunkt, kann aber auf keinen Fall schaden.
Bei kleinen Bäumen kann man stark befallene Blätter auch ablesen und verbrennen. Auch im Herbst sollte man die Blätter einsammeln und vernichten.
Obwohl eine Bekämpfung der Krankheit, von besonderen Fällen abgesehen, nicht unbedingt notwendig ist, verspricht nur frühzeitiges Spritzen eine wirkungsvolle Abhilfe. Das ist natürlich nicht jedermanns Sache und sollte nur bei einem sehr starken Befall im Vorjahr geschehen. Ich schrecke immer noch vor einer Spritzung zurück, habe aber dadurch schon zwei sehr alte Bäume verloren. Im Fachhandel gibt es mehrere Präparate. Die Angaben im Beipackzettel sind sehr genau einzuhalten. Mehrmalige Spritzungen sollten vor und nach der Blüte durchgeführt werden.
Es gibt auch eine ganze Reihe von pflanzenstärkenden Mitteln im Garten-Fachhandel, die auch gespritzt werden können. Stärkungsmaßnahmen wie das Wässern in Trockenzeiten, Bodenverbesserung und Standortoptimierung helfen jeder Pflanze Krankheiten und Schädlinge selbst zu bekämpfen oder mindestens den Befall zu überstehen.

Zusammenfassung
Gymnosporangium sabinae (Wacholderrost) gehört zu den wirtwechselnden Rostpilzen. Er benötigt für seine Entwicklung als Hauptwirt einige Wacholderarten, wobei der einheimische Wacholder [Juniperus communis] nicht zu diesen zählt, und als Nebenwirt die Birne. Der Pilz lebt ausdauernd in dem befallenen Wacholder. Im Frühjahr werden aus den verdickten Triebstellen die gallertartigen Wintersporenlager gebildet. Besonders während Regenperioden werden zahlreiche Sporen freigesetzt, die mit dem Wind auf ihren Nebenwirt, die Birne, gelangen. Bei Trockenheit schrumpfen die Sporenlager am Wacholder ein. Sie bleiben weiterhin infektiös bis wieder günstige Bedingungen eintreten. Ein chemischer Schutz des Wacholders ist zurzeit nicht möglich. Befallene Wacholder sollten entfernt werden. Birnen müssen sich jedes Jahr neu infizieren. Durch das Abwerfen des Laubs sind sie im Winter befallsfrei.